Alex hayvanat bahçesinin en ünlüsüdür ama o çitlerin ötesinde neler olduğunu çok merak etmektedir. En büyük hayali cesur bir kaşif olup yeni yerler keşfetmektir. En iyi arkadaşı Marty korumacı olduğundan kasabanın dışına çıkmaktan korkmaktadır. Penguen Rico'nun da desteğiyle izleyicilerinde katılımıyla birlikte eğlenceli Madagaskar'a kaşiflik macerasının kapısını aralarlar.